chore: remove BMAD framework files and IDE configuration artifacts

Clean up unused BMAD workflow, agent, and command files across all IDE
configurations (.agent, .clinerules, .cursor, .gemini, .github, .kilocode,
.opencode) and internal module files (_bmad/bmb, _bmad/bmm).

Co-Authored-By: Claude Opus 4.5 <noreply@anthropic.com>

docs/CLI_TUTORIAL.md

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+# Tutoriel Entropyk CLI — Mode ligne de commande
+
+Ce tutoriel décrit **pas à pas**, sans raccourci, comment utiliser l’outil Entropyk en **mode CLI** pour construire et lancer une simulation thermodynamique. À la fin, tu auras un système sample fonctionnel et une config JSON réutilisable.
+
+**Public :** utilisateur qui veut tester le CLI (validate, run, batch) et construire un premier système sample.
+
+---
+
+## Sommaire
+
+1. [Prérequis et compilation du CLI](#1-prérequis-et-compilation-du-cli)
+2. [Vérifier l’installation et l’aide](#2-vérifier-linstallation-et-laide)
+3. [Valider un fichier de configuration (validate)](#3-valider-un-fichier-de-configuration-validate)
+4. [Lancer une simulation (run)](#4-lancer-une-simulation-run)
+5. [Comprendre le format JSON (circuits, composants, arêtes)](#5-comprendre-le-format-json)
+6. [Créer notre fichier sample pas à pas](#6-créer-notre-fichier-sample-pas-à-pas)
+7. [Exporter les résultats (option -o)](#7-exporter-les-résultats-option--o)
+8. [Mode batch (optionnel)](#8-mode-batch-optionnel)
+
+---
+
+## 1. Prérequis et compilation du CLI
+
+Tu dois être à la racine du dépôt Entropyk et avoir Rust installé (`rustc`, `cargo`).
+
+**Étape 1.1 — Aller à la racine du projet**
+
+```bash
+cd /chemin/vers/Entropyk
+```
+
+Remplace `/chemin/vers/Entropyk` par ton chemin réel (par exemple `~/dev/Entropyk`).
+
+**Étape 1.2 — Compiler le CLI (release, pour de bonnes perfs)**
+
+```bash
+cargo build --release --package entropyk-cli
+```
+
+La première fois, la compilation peut prendre une à deux minutes. À la fin, l’exécutable se trouve ici :
+
+- **Linux / macOS :** `target/release/entropyk-cli`
+- **Windows :** `target\release\entropyk-cli.exe`
+
+**Étape 1.3 — Vérifier que l’exécutable existe**
+
+Sous Linux/macOS :
+
+```bash
+ls -l target/release/entropyk-cli
+```
+
+Tu dois voir un fichier binaire. Pour l’appeler, tu peux soit utiliser le chemin complet, soit te placer à la racine du projet et lancer :
+
+```bash
+./target/release/entropyk-cli
+```
+
+ou, si `target/release` est dans ton `PATH` :
+
+```bash
+entropyk-cli
+```
+
+Dans la suite du tutoriel, on utilisera `./target/release/entropyk-cli` depuis la racine du projet pour être explicite.
+
+---
+
+## 2. Vérifier l’installation et l’aide
+
+**Étape 2.1 — Afficher l’aide générale**
+
+Depuis la racine du projet :
+
+```bash
+./target/release/entropyk-cli --help
+```
+
+Tu dois voir quelque chose comme :
+
+```text
+Batch thermodynamic simulation CLI
+
+Usage: entropyk-cli [OPTIONS] <COMMAND>
+
+Commands:
+  run       Run a single simulation from a configuration file
+  batch     Run multiple simulations from a directory
+  validate  Validate a configuration file without running
+  help      Print this message or the help of the given subcommand(s)
+
+Options:
+  -v, --verbose  Enable verbose output
+  -q, --quiet    Suppress all output except errors
+  -h, --help     Print help
+```
+
+**Étape 2.2 — Aide de la commande `run`**
+
+```bash
+./target/release/entropyk-cli run --help
+```
+
+Tu dois voir les options `--config` / `-c` (fichier JSON) et `--output` / `-o` (fichier de sortie).
+
+**Étape 2.3 — Aide de la commande `validate`**
+
+```bash
+./target/release/entropyk-cli validate --help
+```
+
+**Étape 2.4 — Aide de la commande `batch`**
+
+```bash
+./target/release/entropyk-cli batch --help
+```
+
+Une fois ces aides lues, tu sais qu’il y a trois commandes principales : **validate**, **run**, **batch**. On commence par **validate** pour s’assurer qu’un fichier de config est valide avant de lancer une simulation.
+
+---
+
+## 3. Valider un fichier de configuration (validate)
+
+La commande **validate** charge le fichier JSON, parse la config (circuits, composants, arêtes, solver, etc.) et affiche si tout est valide. Elle **ne lance pas** la simulation.
+
+**Étape 3.1 — Utiliser un exemple fourni**
+
+Le dépôt contient des exemples dans `crates/cli/examples/`. On prend le plus simple : `simple_working.json`.
+
+Commande (depuis la racine du projet) :
+
+```bash
+./target/release/entropyk-cli validate --config crates/cli/examples/simple_working.json
+```
+
+Tu dois voir un bandeau « ENTROPYK CLI - Configuration Validation » et à la fin :
+
+```text
+  ✓ Configuration is valid
+  File: crates/cli/examples/simple_working.json
+```
+
+**Étape 3.2 — Valider un autre exemple**
+
+Par exemple un chiller R410A minimal :
+
+```bash
+./target/release/entropyk-cli validate --config crates/cli/examples/chiller_r410a_minimal.json
+```
+
+**Étape 3.3 — Vérifier qu’une erreur est bien détectée**
+
+Crée un fichier JSON invalide (par exemple un fichier vide ou du texte qui n’est pas du JSON) et lance :
+
+```bash
+./target/release/entropyk-cli validate --config /chemin/vers/fichier_invalide.json
+```
+
+Tu dois obtenir un message d’erreur (par exemple « Configuration error » ou erreur de parsing). Cela confirme que **validate** sert bien à vérifier la config avant de lancer une simulation.
+
+---
+
+*[Sections 4 à 8 à compléter au fur et à mesure]*